谢邀 首先，我要指出题主题目中的错误。 狗狗的眼睛颜色并不是“不一样”的。
严格来说，所有狗狗的眼睛都是“一样”的。 因为它们的视网膜上，只有锥状细胞（Cone cell）一种有彩色功能的细胞。而锥状细胞又可分为三种，每一种对某种光刺激有特异性反应。
三种不同的锥状细胞，分别对红，绿，蓝三种光刺激有特异性反应。当它们受到这些波长的光刺激时，会兴奋并发送电信号到大脑。 所以，题主所说的“一只黄眼睛，另一只蓝眼睛”是不存在的。。。 如果非要给小狗换个颜色，那也只会是蓝眼睛变成黑眼珠，或者赤瞳变成为深棕或浅褐。 这是因为，所有的狗，在它们刚出生的时候，都是蓝眼睛。
然后，它们的瞳孔会慢慢的变得深邃和浓密。如果父母双方有一方是红眼睛，那么它们的宝宝极有可能出现两只红眼睛的情况。。。 所以嘛，一般情况下，我们见到的狗，都是两只眼睛一黑一黄的。有些犬种，比如拉布拉多，金毛，他们随着年龄的增长，黑色瞳孔周围的黄圈会越来越明显，导致他们的眼睛像铜铃一样。
而有一些犬种，比如伯恩山，贝灵顿，西高地白梗等等，他们的眼睛是一包黑色，看起来像是沉默的黑洞。
逄新宇优质答主1、双眼不同色的狗狗，最有名的莫过于探案高手——哈士奇，相信在狗狗界哈士奇的名声那可是无人不知无人不晓，最能代表哈士奇的特征就是蓝色的双瞳，其实严格说哈士奇很少有一双眼睛全是蓝色，一般是蓝黄各一，这类哈士奇在所有的哈士奇中大约占10%。大多数哈士奇是一只棕黄色、褐色或深褐色的眼睛，另一只是蓝色的眼睛。蓝色眼睛的哈士奇通常比褐色眼睛看起来更漂亮和生动。其实哈士奇本来就是个很特殊的犬种，它来自冰天雪地的北极地区，那是个极夜的地区，很少有阳光照射，所以毛发和眼睛的颜色也就和其它犬种具有明显的区别了，哈士奇毛色一般以黑白和狼青为主，眼睛一般以蓝黄为主，蓝色的眼睛在阳光的照射下格外的明亮和清晰。
2、另外有一种双眼不同色的狗狗就是我们经常见到的边境牧羊犬，边境一般是一只深褐色的，另一只是浅色或者蓝色的。比哈士奇要常见一些，大约占边境犬的20%上下。其实这两种狗本就是牧羊犬，看守的猎物是羊羔，眼睛的颜色和羊羔近似，这样能够融入羊群，不容易受到羊群的排斥，这也是人类选择的结果，经过几千年的自然进化和人工改良，这两类牧羊犬就成了今天这样的外观特征。
3、另外一种则是动物界的“变色龙”——萨摩耶犬，萨摩耶犬的特征就是白色的毛发和桃心的嘴，大部分是两只深褐色的杏核眼，也有少许是蓝色或者是蓝黄双色的，这种的萨摩耶犬不多，大约占5%以下。萨摩耶犬本来是生活在雪域高原的雪橇犬，被俄罗斯人和欧洲人改进成家养宠物犬，但是萨摩耶犬的“变色龙”本性使它能够适应各种环境，眼睛的颜色也会随环境的变化而变化。在阳光充足的地方和光照不足的地方眼睛呈现明显不同的颜色。
在其它的犬种中很少有双眼不同色的狗，比如北京犬、马尔济斯犬、吉娃娃犬、金毛犬、杜宾犬、罗威纳犬、阿富汗犬、西施犬、比熊犬、中华田园犬（土狗）……，在这些犬种中极个别也会出现一只不同色的情况，通常是一只深色的，一只浅色的，这样的出现概率很低，一般是低于1%，主要是因为饲养繁殖的方法不正确，没有经过科学的配对造成基因异常，从而出现双眼不同色，属于变异和畸形的犬类，在繁殖中一般都是淘汰处理，这样的变异犬如果出卖一般价格很低。所以大家想养纯种狗最好到正规的宠物店、宠物市场或宠物商店，一定要选则没有任何缺陷的纯种仔犬，这样才能保证今后的健康生活。
